クロージャー・ウイルスと呼ばれるウイルスの大流行によって人類が危機に直面した世界。

少年エノアと少女ハナはウイルスによる病魔に冒された末期状態の科学者と共に、三人で暮らしていた。世界はもう、自分たちだけだと思っていた。

ある日、エノア達の住む地へ数機の軍用ヘリが降り立つ。

原父（プロパテール）連邦を名乗る彼らはエノア達と暮らす科学者を連れ去ろうとするが、エノアはロボットのケルビムにて応戦し、ケルビムの圧倒的破壊力の前に勝利する。